При удалении из АД пользователей, в списке nextcloud они остаются, хоть и становятся не активными, это не удобно. Удалять придется из консоли.
Перейдем в каталог nextcloud
cd /var/www/nextcloud/
Список пользователей помеченных на удаление
sudo -E -u www-data php occ ldap:show-remnants
удаление пользователя
sudo -E -u www-data php occ user:delete User1